Вопрос по r, colors, ggplot2, polygon – Как заполнить geom_polygon разными цветами выше и ниже y = 0?

14

Учитывая следующий полигональный график:

ggplot(df, aes(x=year,y=afw)) +
  geom_polygon() +
  scale_x_continuous("", expand=c(0,0), breaks=seq(1910,2010,10)) +
  theme_bw()

Тем не менее, я хочу заполнить это двумя разными цветами. Например красный для черных областей выше0 и синий для черных областей ниже0, К сожалению, используяfill=col не заполняет правильные области.

Я попробовал следующий код (я добавилgeom_line чтобы проиллюстрировать, где должна быть граница заливки):

ggplot(df, aes(x=year,y=afw)) +
  geom_line() +
  geom_polygon(aes(fill=col), alpha=0.5) +
  scale_x_continuous("", expand=c(0,0), breaks=seq(1910,2010,10)) +
  theme_bw()

который дает:

Как видите, он заполняет гораздо больше, чем должен. Как я могу решить это?

Данные:

df <- structure(list(year = c(1901, 1901, 1901, 1902, 1903, 1904, 1905, 1906, 1907, 1908, 1909, 1910, 1911, 1912, 1913, 1914, 1915, 1916, 1917, 1918, 1919, 1920, 1921, 1922, 1923, 1924, 1925, 1926, 1927, 1928, 1929, 1930, 1931, 1932, 1933, 1934, 1935, 1936, 1937, 1938, 1939, 1940, 1941, 1942, 1943, 1944, 1945, 1946, 1947, 1948, 1949, 1950, 1951, 1952, 1953, 1954, 1955, 1956, 1957, 1958, 1959, 1960, 1961, 1962, 1963, 1964, 1965, 1966, 1967, 1968, 1969, 1970, 1971, 1972, 1973, 1974, 1975, 1976, 1977, 1978, 1979, 1980, 1981, 1982, 1983, 1984, 1985, 1986, 1987, 1988, 1989, 1990, 1991, 1992, 1993, 1994, 1995, 1996, 1997, 1998, 1999, 2000, 2001, 2002, 2003, 2004, 2005, 2006, 2007, 2008, 2009, 2010, 2011, 2012, 2013, 2013, 2013), afw = c(0, 0, -0.246246074793035, -2.39463317156723, -2.39785897801884, 0.840850699400514, -0.843020268341422, -3.02043962318013, -0.033342848986583, -2.04947188124465, -0.00431059092206709, 2.49568940907793, 1.96988295746503, 2.26665715101342, 0.986011989723095, 1.79568940907793, 2.06665715101342, -0.601084784470454, -3.21076220382529, 2.65052811875535, 0.46988295746503, -1.09140736511562, 0.0505281187553526, 1.41827005423922, -2.80108478447045, 0.611818441335997, -1.83011704253497, -0.30753639737368, -4.43011704253497, -0.897858978018841, 1.98601198972309, -0.965600913502712, 0.0795603768198685, 0.308592634884385, -5.33011704253497, 4.00214102198116, -0.594633171567228, 0.0698829574650297, -1.60753639737368, -2.81398801027691, -2.21398801027691, -2.4365686554382, 1.53439908649729, 1.06665715101342, -1.87205252640594, -0.688181558664002, 0.0569797316585783, -3.51398801027691, 0.979560376819868, 0.289237796174707, 1.24085069940051, -4.39140736511562, 1.13117328004567, -1.72689123608336, 2.20214102198116, 2.27310876391664, 1.46665715101342, 2.18278618327148, -0.23011704253497, 1.50536682843277, 1.17633457036826, -0.0785041393091639, -1.54947188124465, -3.85269768769626, -4.31398801027691, -0.80753639737368, 1.27956037681987, 1.2376248929489, 0.195689409077933, -3.38172994576078, -4.88172994576078, -0.675278332857551, 2.25375392520697, 0.0924636026263199, -0.446246074793035, 4.06988295746503, 0.350528118755352, -1.48172994576078, 1.81504424778761, -1.42689123608336, 2.22472166714245, 0.376334570368256, -3.88495575221239, 0.211818441335998, 0.586011989723094, 1.14407650585213, 2.55697973165858, 1.92794747359406, 1.20214102198116, 3.83439908649729, 1.64407650585213, 0.986011989723095, 0.753753925206965, 0.508592634884385, 1.911818441336, 2.11504424778761, -4.06560091350271, -2.58495575221239, 1.80859263488438, 1.37956037681987, 1.58923779617471, 1.88601198972309, -0.323665429631744, -0.291407365115615, 0.818270054239223, 0.0569797316585783, 0.795689409077933, 3.32472166714245, 0.595689409077933, -0.733342848986583, -0.955923494147874, -4.32689123608336, 3.29891521552955, 1.85697973165858, 2.74407650585213, 0, 0), col = structure(c(1L, 2L, 1L, 1L, 1L, 2L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 1L, 1L, 2L, 2L, 1L, 2L, 2L, 1L, 2L, 1L, 1L, 1L, 1L, 2L, 1L, 2L, 2L, 1L, 2L, 1L, 2L, 1L, 1L, 1L, 1L, 2L, 2L, 1L, 1L, 2L, 1L, 2L, 2L, 2L, 1L, 2L, 1L, 2L, 2L, 2L, 2L, 1L, 2L, 2L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 2L, 2L, 2L, 1L, 1L, 1L, 2L, 2L, 1L, 2L, 2L, 1L, 2L, 1L, 2L, 2L, 1L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 1L, 1L, 2L, 2L, 2L, 2L, 1L, 1L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 1L, 1L, 1L, 2L, 2L, 2L, 2L, 1L), .Label = c("B", "A"), class = "factor")), .Names = c("year", "afw", "col"), class = c("tbl_df", "data.frame"), row.names = c(NA, -117L))

Примечание. Как видно из данных, для 1901 и 2013 годов есть 3 строки. Я сделал это, потому что хотел получить правильное заполнение. Хотя чёрная заливка верна, мне кажется, что не получается рабочее решение с цветами.

Исходный набор данных:

orig <- structure(list(year = c(1901, 1902, 1903, 1904, 1905, 1906, 1907, 1908, 1909, 1910, 1911, 1912, 1913, 1914, 1915, 1916, 1917, 1918, 1919, 1920, 1921, 1922, 1923, 1924, 1925, 1926, 1927, 1928, 1929, 1930, 1931, 1932, 1933, 1934, 1935, 1936, 1937, 1938, 1939, 1940, 1941, 1942, 1943, 1944, 1945, 1946, 1947, 1948, 1949, 1950, 1951, 1952, 1953, 1954, 1955, 1956, 1957, 1958, 1959, 1960, 1961, 1962, 1963, 1964, 1965, 1966, 1967, 1968, 1969, 1970, 1971, 1972, 1973, 1974, 1975, 1976, 1977, 1978, 1979, 1980, 1981, 1982, 1983, 1984, 1985, 1986, 1987, 1988, 1989, 1990, 1991, 1992, 1993, 1994, 1995, 1996, 1997, 1998, 1999, 2000, 2001, 2002, 2003, 2004, 2005, 2006, 2007, 2008, 2009, 2010, 2011, 2012, 2013), afw = c(-0.246246074793035, -2.39463317156723, -2.39785897801884, 0.840850699400514, -0.843020268341422, -3.02043962318013, -0.033342848986583, -2.04947188124465, -0.00431059092206709, 2.49568940907793, 1.96988295746503, 2.26665715101342, 0.986011989723095, 1.79568940907793, 2.06665715101342, -0.601084784470454, -3.21076220382529, 2.65052811875535, 0.46988295746503, -1.09140736511562, 0.0505281187553526, 1.41827005423922, -2.80108478447045, 0.611818441335997, -1.83011704253497, -0.30753639737368, -4.43011704253497, -0.897858978018841, 1.98601198972309, -0.965600913502712, 0.0795603768198685, 0.308592634884385, -5.33011704253497, 4.00214102198116, -0.594633171567228, 0.0698829574650297, -1.60753639737368, -2.81398801027691, -2.21398801027691, -2.4365686554382, 1.53439908649729, 1.06665715101342, -1.87205252640594, -0.688181558664002, 0.0569797316585783, -3.51398801027691, 0.979560376819868, 0.289237796174707, 1.24085069940051, -4.39140736511562, 1.13117328004567, -1.72689123608336, 2.20214102198116, 2.27310876391664, 1.46665715101342, 2.18278618327148, -0.23011704253497, 1.50536682843277, 1.17633457036826, -0.0785041393091639, -1.54947188124465, -3.85269768769626, -4.31398801027691, -0.80753639737368, 1.27956037681987, 1.2376248929489, 0.195689409077933, -3.38172994576078, -4.88172994576078, -0.675278332857551, 2.25375392520697, 0.0924636026263199, -0.446246074793035, 4.06988295746503, 0.350528118755352, -1.48172994576078, 1.81504424778761, -1.42689123608336, 2.22472166714245, 0.376334570368256, -3.88495575221239, 0.211818441335998, 0.586011989723094, 1.14407650585213, 2.55697973165858, 1.92794747359406, 1.20214102198116, 3.83439908649729, 1.64407650585213, 0.986011989723095, 0.753753925206965, 0.508592634884385, 1.911818441336, 2.11504424778761, -4.06560091350271, -2.58495575221239, 1.80859263488438, 1.37956037681987, 1.58923779617471, 1.88601198972309, -0.323665429631744, -0.291407365115615, 0.818270054239223, 0.0569797316585783, 0.795689409077933, 3.32472166714245, 0.595689409077933, -0.733342848986583, -0.955923494147874, -4.32689123608336, 3.29891521552955, 1.85697973165858, 2.74407650585213)), .Names = c("year", "afw"), class = c("tbl_df", "data.frame"), row.names = c(NA, -113L))

Ваш Ответ

2   ответа
12

kohskeответВот, Все кредиты ему. Дополнительные точки данных генерируются линейной интерполяцией, а график -geom_area.

Во-первых, небольшой пример, который облегчает понимание линейной интерполяции и того, какие точки добавляются к исходным данным:

# original data
d <- data.frame(x = c(1:6),
                y = c(-1, 2, 1, 2, -1, 1))

# add a grouping variable just to keep track of original and interpolated points
d$grp <- "orig"

# create interpolated points
d <- d[order(d$x),]

new_d <- do.call("rbind",
              sapply(1:(nrow(d) -1), function(i){
                f <- lm(x ~ y, d[i:(i+1), ])
                if (f$qr$rank < 2) return(NULL)
                r <- predict(f, newdata = data.frame(y = 0))
                if(d[i, ]$x < r & r < d[i+1, ]$x)
                  return(data.frame(x = r, y = 0))
                else return(NULL)
              })
)

new_d$grp <- "new"

# combine original and interpolated data
d2 <- rbind(d, new_d)
d2   
#           x  y  grp
# 1  1.000000 -1 orig
# 2  2.000000  2 orig
# 3  3.000000  1 orig
# 4  4.000000  2 orig
# 5  5.000000 -1 orig
# 6  6.000000  1 orig
# 13 1.333333  0  new
# 11 4.666667  0  new
# 12 5.500000  0  new

# similar plot as below, but points are added, with different color (original vs new)
ggplot(data = d2, aes(x = x, y = y)) +
  geom_area(data = subset(d2, y <= 0), fill = "red", alpha = 0.2) +
  geom_area(data = subset(d2, y >= 0), fill = "blue", alpha = 0.2) +
  geom_point(aes(color = grp), size = 10) +
  theme_bw()

Ваши данные:

orig <- orig[order(orig$year), ]

rx <- do.call("rbind",
              sapply(1:(nrow(orig) - 1), function(i){
                f <- lm(year ~ afw, orig[i:(i+1), ])
                if (f$qr$rank < 2) return(NULL)
                r <- predict(f, newdata = data.frame(afw = 0))
                if(orig[i, ]$year < r & r < orig[i + 1, ]$year)
                  return(data.frame(year = r, afw = 0))
                else return(NULL)
              })
)
d2 <- rbind(orig, rx)

ggplot(d2, aes(x = year, y = afw)) +
  geom_area(data = subset(d2, afw <= 0), fill = "red") +
  geom_area(data = subset(d2, afw >= 0), fill = "blue") +
  scale_x_continuous("", expand = c(0,0), breaks = seq(1910, 2010, 10)) +
  theme_bw()

Спасибо за ваш хороший и продуманный ответ. Тем не менее, как уже сказал @ jaysunice3401, все еще есть некоторые проблемы с качеством сюжета: границаgeom_area все еще довольно грубо. Я обновляю свой вопрос с возможным руководством для решения. Можете ли вы взглянуть на это? Jaap
Извините за путаницу, но я не пробовал ваш код до сих пор. Я оценил ваш вклад на основе сопровождающего сюжета. Виноват. После запуска вашего кода, он дает мне решение, которое я хотел :-) Jaap
Я также удалил обновление моего вопроса, потому что это более или менее описание того, что вы сделали. Jaap
13

и мне интересно посмотреть, что придут другие ...

Причина «множественных» цветных областей состоит в том, что один полигон ограничен точками данных, а точки данных фактически не равны нулю.

Чтобы решить эту проблему, мы можем интерполировать, используяapprox(), Для идеального решения вам необходимо точно определить, где линия пересекает ноль.

interp <- approx(orig$year, orig$afw, n=10000)

orig2 <- data.frame(year=interp$x, afw=interp$y)
orig2$col[orig2$afw >= 0] <- "pos"
orig2$col[orig2$afw < 0] <- "neg"

ggplot(orig2, aes(x=year, y=afw)) +
  geom_area(aes(fill=col)) +
  geom_line() +
  geom_hline(yintercept=0)

Тем не менее, вы увидите, что это по-прежнему имеет проблемы при увеличении:

Чтобы уточнить мое утверждение выше (и дополнительно проиллюстрировать исходную «проблему / проблему»), рассмотрим, что происходит, когда вы строите каждый из исходных положительных и отрицательных наборов данных отдельно:

p1 <- ggplot(subset(orig, col == "neg"), aes(x = year, y = afw)) +
  geom_area(aes(fill=col)) +
  scale_fill_manual(values = c("#FF3030", "#00CC66"))

p2 <- ggplot(subset(orig, col == "pos"), aes(x = year, y = afw)) +
  geom_area(aes(fill=col)) +
  scale_fill_manual(values = c("#00CC66", "#FF3030"))

library(gridExtra)

grid.arrange(p2, p1)

Конечно, вы всегда можете решить эту проблему, используя другой тип визуализации:

ggplot(data = orig, aes(x = year, y = afw)) +
  geom_bar(stat = "identity", aes(fill=col), colour = "white")

Спасибо за ваш хороший и продуманный ответ. Однако, как вы уже сказали, есть некоторые проблемы с качеством сюжета. Я обновляю свой вопрос с возможным руководством для решения. Можете ли вы взглянуть на это? Jaap

Похожие вопросы